土壌や根圏、さらには植物組織内には様々な微生物が生息しており、植物の生育や健康状態に大きな影響を与えていると考えられます。本グループでは、シングルセルゲノム解析技術や共焦点顕微ラマン分光法といった最先端技術を用いて、多様な土壌に生息する微生物ゲノム情報の収集・解析を行い、それらをデータベース化した「農業土壌微生物叢アトラス」の作成を行います。